Burago di Molgora sorge nella pianura lombarda, a 182 metri sul livello del mare, in un territorio densamente popolato e fortemente urbanizzato, con una densità di 1 274 abitanti per km². Distante 138 km dal mare, il paese è immerso nella Brianza, una regione di antica vocazione agricola oggi trasformata in area metropolitana. Il suolo consumato raggiunge il 35,1%, segno di un'intensa antropizzazione.
L'economia locale è integrata nel sistema produttivo milanese, con un reddito medio di 29 299 € e un prezzo degli immobili di 1 520 €/m². Il territorio rientra nell'area di produzione del Grana Padano DOP e del Gorgonzola DOP, oltre ad altri formaggi tipici come il Bitto DOP e il Formai de Mut dell'Alta Valle Brembana DOP. La copertura FTTH è del 73%, a testimonianza di una buona connettività.
Il clima è temperato, con temperatura media di 12,4 °C e precipitazioni annue di 1 084 mm. L'indice di vecchiaia è alto (257) e il saldo naturale negativo (-19). Il rischio idrogeologico è basso. Il patrimonio monumentale conta 13 siti, e nelle vicinanze si trovano due siti UNESCO: il villaggio operaio di Crespi d'Adda a Capriate San Gervasio e il centro storico di Milano.
