Fornovo San Giovanni sorge nella pianura bergamasca, a 109 metri sul livello del mare e a 134 km dalla costa, in un paesaggio agricolo segnato da campi coltivati e canali irrigui. Con una superficie di appena 7 km² e una densità di 486 ab/km², il paese è un compatto nucleo rurale che conserva il carattere di borgo di campagna, lontano dal caos metropolitano ma ben collegato al sistema locale di Bergamo.
L'economia locale si basa su agricoltura e piccole imprese: il reddito medio annuo è di 25.219 €, mentre il prezzo delle case si attesta a 883 €/m², rendendo l'abitare accessibile. La copertura FTTH raggiunge il 68% delle famiglie.
Il clima è continentale, con una temperatura media di 12,4 °C e precipitazioni annue di 1.084 mm. La qualità della vita è favorita dalla vicinanza a siti UNESCO come Crespi d'Adda e Milano, raggiungibili in meno di un'ora.