San Marco d'Alunzio sorge su uno sperone collinare dei Monti Nebrodi, a 548 metri d'altezza, dominando la valle del torrente San Marco. Il suo territorio, di 26,1 km², è caratterizzato da un paesaggio ondulato di uliveti e boschi, con la vetta della Rocca Traora (999 m) che segna il confine orientale. La bassa densità abitativa (68 ab/km²) e i 1.775 residenti rendono il borgo raccolto e autentico, lontano dal caos costiero (57 km dal mare).
L'economia si basa su agricoltura e turismo lento. Il reddito medio annuo è di 16.480 €, mentre il prezzo delle case si attesta sui 518 €/m².
Il clima è mediterraneo temperato, con 18,9 °C di media e 645 mm di pioggia annui. Il borgo vanta 3 monumenti e 2 musei, tra cui spiccano la chiesa madre e i resti del castello normanno. Con un'età media di 47,3 anni e un indice di vecchiaia di 246, la comunità è radicata ma aperta a nuovi arrivi.