Villanuova sul Clisi sorge su un territorio collinare modellato dai ghiacciai, tra le vette del Monte Covolo (552 m) e del Monte Renico (886 m). Il paese si trova a 148 km dal mare, in una conca solcata dal torrente Clisi, che offre sentieri come quelli verso la grotta Büs del Calanch e la sorgente Fontana Fistola. Con 5.929 abitanti e una densità di 652 ab/km², è un centro di dimensioni contenute ma vivace, inserito nel sistema locale di Salò.
L'economia locale si basa su servizi e piccola industria, con un reddito medio di 24.326 euro e un prezzo immobiliare di 1.120 €/m². La copertura FTTH raggiunge il 73% delle abitazioni. Il terroir riflette la fertilità delle colline moreniche.
Il clima è temperato, con 13,2 °C medi e 1.058 mm di pioggia annui. L'indice di vecchiaia è alto (220) e il saldo naturale negativo (-53). Tra i monumenti spiccano il duomo di Salò e Palazzo Terzi-Martinengo nei dintorni; la qualità della vita è scandita da un ritmo tranquillo, con 6 sentieri escursionistici censiti.