Zapponeta sorge nella vasta pianura del Tavoliere delle Puglie, a soli 10 metri sul livello del mare e a 34 km dalla costa adriatica. Il paesaggio è dominato da campi coltivati e da un cielo ampio, con un territorio comunale di 41,8 km² che ospita una popolazione di 3.192 abitanti, per una densità di 76 ab/km². La pianura, un tempo paludosa e poi bonificata, conserva tracce di un ambiente rurale ancora autentico.
L'economia locale si basa sull'agricoltura e su attività artigianali, con un reddito medio annuo di 11.859 € e una pressione fiscale contenuta al 10,3%. Il territorio rientra nell'area di produzione di eccellenze come il Caciocavallo Silano DOP, il Canestrato Pugliese DOP e il Capocollo di Martina Franca DOP, mentre la copertura FTTH raggiunge il 55% delle abitazioni, segno di una connettività in crescita.
Il clima è mite, con una temperatura media di 16,2 °C e precipitazioni annue di 478 mm, ma il rischio idrogeologico è molto alto a causa della natura pianeggiante e della vicinanza a canali di bonifica. Nonostante ciò, il suolo consumato è solo il 3,1%, a testimonianza di un territorio ancora poco urbanizzato. Tra i monumenti si contano due edifici storici, mentre il centro è dedicato alla Madonna della Misericordia, patrona del borgo. Nelle vicinanze spiccano il sito UNESCO di Andria e il borgo di Monte Sant'Angelo.