Passignano sorge su una collina che digrada dolcemente verso il Lago Trasimeno, a 289 metri di altitudine, con vette come Poggio Castelluccio (744 m) e Colle Campana (798 m) a incorniciare il paesaggio. Il territorio, esteso per 81,3 km², è caratterizzato da una densità abitativa di 70 ab/km² e da un clima mite, con una temperatura media di 12,4 °C e precipitazioni annue di 922 mm.
L'economia locale si basa su turismo, agricoltura e piccolo commercio: il reddito medio annuo è di 21.836 €, il prezzo medio delle case di 753 €/m². La copertura FTTH è al 55%.
Il patrimonio conta 18 monumenti e un museo. Tra i siti UNESCO raggiungibili entro 60 km ci sono Pienza e Assisi. La pressione fiscale è del 17,7%, l'indice di vecchiaia di 258 e il saldo naturale negativo (-27).