Peschiera Borromeo sorge nella pianura lombarda, a 107 metri sul livello del mare, lontana 119 chilometri dalla costa. Il suo territorio è caratterizzato dalla presenza di fontanili, antiche risorgive che alimentano una rete di rogge e canali: tra questi spiccano il Fontanile Gambarone e il Fontanile Floriano. Con una superficie di 23,2 km² e una densità di 1.049 abitanti per km², il paese si presenta come un centro urbanizzato ma ancora legato alla tradizione agricola della Bassa Milanese.
L'economia locale beneficia della vicinanza a Milano, con un reddito medio annuo di 34.441 euro e un prezzo degli immobili di 1.993 euro al metro quadro. La copertura FTTH raggiunge l'86% delle abitazioni, segno di una buona connettività. Il territorio rientra nell'area di produzione di celebri formaggi DOP come Gorgonzola, Grana Padano e Bitto, e di altre specialità come il Mais Spinoso di Gandino DOP.
Il clima è temperato, con una temperatura media di 12,4 °C e precipitazioni annue di 1.084 mm. Il rischio idrogeologico è medio e il suolo consumato è pari al 29,3%. Il comune vanta 37 monumenti e offre un punto panoramico detto Punto di osservazione del Canneto. Con un'età media di 45,6 anni e un indice di vecchiaia di 191, la popolazione riflette il trend di invecchiamento tipico della regione, ma mantiene un saldo naturale negativo di -32 unità.
