San Giacomo delle Segnate sorge nella bassa pianura padana, a soli 16 metri d'altitudine, un paesaggio modellato da secoli di bonifiche e colture intensive. Il comune, esteso su 16 chilometri quadrati, conta una densità di 94 abitanti per km², con un indice di vecchiaia elevato (315) che riflette una popolazione anziana e un saldo naturale negativo (-16).
Il reddito medio si attesta a 22.706 euro, mentre il prezzo delle case è contenuto (475 €/m²). La copertura FTTH raggiunge il 65%, segnale di una connettività in miglioramento.
Il clima è continentale, con temperature medie di 14,3 °C e precipitazioni annue di 776 mm. Tra i due monumenti del paese spicca la chiesa parrocchiale dedicata a san Giacomo il Maggiore. A circa 60 km si trovano i siti UNESCO di Mantova e Modena.