San Giovanni Valdarno sorge nella piana alluvionale del Valdarno Superiore, a 134 metri sul livello del mare, incastonata tra i rilievi del Chianti e del Pratomagno. Il paesaggio è quello tipico della media valle dell'Arno, con campi coltivati e filari di vite che si estendono fino alle pendici collinari. Con 16 564 residenti e una densità di 772 abitanti per km², è un centro densamente popolato che conserva un forte legame con la tradizione agricola.
L'economia locale si basa su un mix di artigianato, commercio e servizi, con un reddito medio di 23 987 € e un prezzo delle case di 1 322 €/m². Il territorio rientra nell'area di produzione del Chianti DOCG e del Chianti Classico DOP, ma il prodotto più identitario è il Pollo del Valdarno IGP, che porta il nome del comune. La copertura FTTH raggiunge il 62% delle abitazioni, segno di una discreta connettività.
Il centro storico vanta 81 monumenti, tra cui spicca Palazzo d'Arnolfo. L'indice di vecchiaia è alto (259) e il saldo naturale negativo (-99), mentre il rischio idrogeologico è molto alto e il suolo consumato è al 18,1%. A meno di un'ora si raggiungono i siti UNESCO di Siena e Firenze.